Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933424G06RikA0A140LIP3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933424G06RikA0A140LIP3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms