Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RNP2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RNP2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RNP2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RNP2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RNP2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0U1RNP2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RNP2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RNP2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RNP2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0U1RNP2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A0U1RNP2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RNP2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0U1RNP2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RNP2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RNP2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RNP2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RNP2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RNP2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RNP2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RNP2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RNP2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms