Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms