Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbv21A0A0A6YX06 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbv21A0A0A6YX06 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbv21A0A0A6YX06 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbv21A0A0A6YX06 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trbv21A0A0A6YX06 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trbv21A0A0A6YX06 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trbv21A0A0A6YX06 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trbv21A0A0A6YX06 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbv21A0A0A6YX06 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbv21A0A0A6YX06 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbv21A0A0A6YX06 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trbv21A0A0A6YX06 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Trbv21A0A0A6YX06 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trbv21A0A0A6YX06 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Trbv21A0A0A6YX06 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Trbv21A0A0A6YX06 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Trbv21A0A0A6YX06 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trbv21A0A0A6YX06 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trbv21A0A0A6YX06 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Trbv21A0A0A6YX06 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Trbv21A0A0A6YX06 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trbv21A0A0A6YX06 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trbv21A0A0A6YX06 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Trbv21A0A0A6YX06 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trbv21A0A0A6YX06 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trbv21A0A0A6YX06 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trbv21A0A0A6YX06 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
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Trbv21A0A0A6YX06 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
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Trbv21A0A0A6YX06 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trbv21A0A0A6YX06 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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