Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Speer3W4VSP1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Speer3W4VSP1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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