Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm3550W4VSN7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms