Protein–RNA interactions for Protein: V9GXS8

Gm11983, Predicted gene 11983, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11983V9GXS8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm11983V9GXS8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11983V9GXS8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11983V9GXS8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm11983V9GXS8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms