Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vstm4T1NXB5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms