Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms