Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CcniQ9Z2V9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms