Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ubl3Q9Z2M6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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