Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pdpk1Q9Z2A0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pdpk1Q9Z2A0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pdpk1Q9Z2A0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Pdpk1Q9Z2A0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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