Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Cldn7Q9Z261 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Cldn7Q9Z261 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn7Q9Z261 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms