Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccne2Q9Z238 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccne2Q9Z238 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccne2Q9Z238 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccne2Q9Z238 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccne2Q9Z238 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccne2Q9Z238 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccne2Q9Z238 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccne2Q9Z238 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms