Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms