Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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AireQ9Z0E3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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AireQ9Z0E3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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AireQ9Z0E3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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AireQ9Z0E3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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AireQ9Z0E3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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AireQ9Z0E3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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AireQ9Z0E3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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AireQ9Z0E3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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AireQ9Z0E3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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AireQ9Z0E3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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AireQ9Z0E3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AireQ9Z0E3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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