Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
CcsQ9WU84 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcsQ9WU84 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcsQ9WU84 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcsQ9WU84 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcsQ9WU84 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcsQ9WU84 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcsQ9WU84 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcsQ9WU84 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CcsQ9WU84 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms