Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vax2Q9WTP9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms