Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms