Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek3Q9R0A5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms