Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gpc6Q9R087 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms