Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf25Q9QZR0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf25Q9QZR0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf25Q9QZR0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf25Q9QZR0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf25Q9QZR0 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf25Q9QZR0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf25Q9QZR0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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