Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ercc4Q9QZD4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms