Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn8Q9QZ49 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms