Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Phtf1Q9QZ09 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Phtf1Q9QZ09 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Phtf1Q9QZ09 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Phtf1Q9QZ09 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phtf1Q9QZ09 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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