Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kcnip3Q9QXT8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms