Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP7

C1qtnf1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf1Q9QXP7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf1Q9QXP7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms