Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt1Q9JMD1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms