Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cabp1Q9JLK7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms