Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Col5a3Q9JLI2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Col5a3Q9JLI2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Col5a3Q9JLI2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col5a3Q9JLI2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Col5a3Q9JLI2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Col5a3Q9JLI2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Col5a3Q9JLI2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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