Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms