Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rfx5Q9JL61 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rfx5Q9JL61 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rfx5Q9JL61 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rfx5Q9JL61 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rfx5Q9JL61 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rfx5Q9JL61 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rfx5Q9JL61 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rfx5Q9JL61 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rfx5Q9JL61 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rfx5Q9JL61 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx5Q9JL61 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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