Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn5Q9JL35 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms