Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cyp39a1Q9JKJ9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms