Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zfhx4Q9JJN2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfhx4Q9JJN2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms