Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms