Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mkrn2Q9ERV1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms