Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cxcr6Q9EQ16 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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