Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms