Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Rnft1Q9DCN7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Rnft1Q9DCN7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Rnft1Q9DCN7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Rnft1Q9DCN7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Rnft1Q9DCN7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Rnft1Q9DCN7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnft1Q9DCN7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Rnft1Q9DCN7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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