Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syde1Q9DBZ9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms