Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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