Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenooQ9DBC0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms