Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms