Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms