Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms