Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Alg13Q9D8C3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Alg13Q9D8C3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Alg13Q9D8C3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Alg13Q9D8C3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Alg13Q9D8C3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Alg13Q9D8C3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Alg13Q9D8C3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Alg13Q9D8C3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Alg13Q9D8C3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Alg13Q9D8C3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Alg13Q9D8C3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms