Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn9Q9D805 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn9Q9D805 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms