Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D7E4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D7E4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms