Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp19Q9D7A6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp19Q9D7A6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms